What to do for infected kidney stones?

Medical Advisory BoardAll articles are reviewed for accuracy by our Medical Advisory Board
Educational purpose only • Exercise caution as content is pending human review
Article Review Status
Submitted
Under Review
Approved

Last updated: December 5, 2025View editorial policy

Personalize

Help us tailor your experience

Which best describes you? Your choice helps us use language that's most understandable for you.

Néphrolithiase Infectée : Prise en Charge

En présence d'une néphrolithiase infectée avec obstruction, le drainage urgent du système collecteur par sonde de néphrostomie ou endoprothèse urétérale doit être réalisé immédiatement, suivi d'une antibiothérapie à large spectre, avec report du traitement définitif du calcul jusqu'à résolution complète de l'infection. 1, 2

Reconnaissance de l'Urgence

La néphrolithiase obstructive avec infection constitue une urgence urologique pouvant évoluer vers la septicémie et le décès. 3 Les signes cliniques évocateurs incluent :

  • Fièvre avec douleur lombaire ou abdominale aiguë 1
  • Leucocytose >11 × 10⁹/L 1
  • CRP sérique ≥50 mg/L 1
  • Présence d'obstruction urétérale à l'imagerie 1, 2

Drainage Urgent (Première Priorité)

Le drainage du système collecteur doit être effectué en urgence avant toute tentative de retrait du calcul. 1, 2 Les options incluent :

  • Néphrostomie percutanée : permet le drainage de l'urine infectée et la pénétration des antibiotiques dans l'unité rénale affectée 1
  • Endoprothèse urétérale rétrograde : alternative au tube de néphrostomie selon les facteurs cliniques (âge, comorbidités, habitus corporel) 1

Le risque de la procédure doit être évalué par rapport au bénéfice, mais le drainage reste impératif en présence d'infection obstructive. 1

Antibiothérapie Immédiate

Prélèvements Préalables

  • Hémocultures si infection des voies urinaires supérieures ou infection de kyste rénal suspectée 1
  • Culture d'urine avant l'initiation des antibiotiques pour guider l'ajustement thérapeutique 1, 2

Choix Antibiotique Initial

Pour une infection obstructive suspectée, démarrer immédiatement une antibiothérapie empirique à large spectre couvrant les entérobactéries gram-négatives : 1

  • Céphalosporine de 3ème génération IV (avec ou sans fluoroquinolone) 1
  • Les fluoroquinolones ou céphalosporines de 3ème génération sont préférées si atteinte des voies supérieures, avec des données récentes suggérant la supériorité des céphalosporines de 3ème génération 2

Durée du Traitement

  • 4 à 6 semaines d'antibiotiques liposolubles (ex : triméthoprime-sulfaméthoxazole, fluoroquinolone) pour infection des voies supérieures, car ils pénètrent mieux dans les calculs et tissus rénaux 1, 2
  • Ajuster selon les résultats de culture et antibiogramme dans les 48-72 heures 2
  • Après stabilisation clinique, passage possible à une antibiothérapie orale selon les résultats de culture 1

Attention : Les fluoroquinolones sont associées à un risque accru de tendinopathies et d'anévrismes/dissections aortiques. 1

Gestion Peropératoire

Si une procédure endoscopique est tentée et que de l'urine purulente est rencontrée :

  • Interrompre immédiatement la procédure de retrait du calcul 1, 4
  • Établir un drainage (néphrostomie ou endoprothèse) 1
  • Poursuivre l'antibiothérapie à large spectre 1
  • Reporter le traitement définitif du calcul 1, 2

Traitement Définitif du Calcul (Après Résolution de l'Infection)

Le retrait complet du calcul est essentiel pour prévenir la croissance calculeuse récurrente, les infections urinaires récidivantes et les lésions rénales. 1, 3

Choix de la Technique

Pour les calculs d'infection ou fragments résiduels suspects d'infection :

  • Procédures endoscopiques recommandées pour rendre le patient sans calcul 1
  • Néphrolithotomie percutanée (NLPC) : première ligne pour charge calculeuse totale >20 mm (taux sans calcul ~94%) 1
  • Urétéroscopie (URS) : option pour calculs ≤20 mm (taux sans calcul ~75-95% selon la taille) 1, 4
  • Lithotripsie extracorporelle (LEC) : ne doit pas être offerte en première ligne pour charge >20 mm 1
  • Chirurgie ouverte/laparoscopique/robotique : réservée aux cas exceptionnels avec anomalies anatomiques ou nécessitant reconstruction concomitante 1

Prophylaxie Antibiotique Périopératoire

  • Administrer dans les 60 minutes précédant la procédure 1
  • Basée sur les résultats de culture urinaire antérieure et l'antibiogramme local 1, 4
  • Redosage pendant la procédure si la durée le nécessite 1

Analyse du Calcul

Le matériel calcique doit être envoyé pour analyse afin d'identifier les calculs d'infection (struvite, apatite carbonatée) et guider la prévention. 1, 4

Pièges à Éviter

  • Ne jamais tenter le retrait du calcul avant drainage en présence d'infection obstructive - risque de septicémie sévère 1, 2
  • Ne pas utiliser la nitrofurantoïne ou fosfomycine si infection des voies supérieures suspectée (données insuffisantes) 2
  • Ne pas sous-estimer les calculs résiduels : 43% des patients développent un événement lié au calcul après NLPC avec fragments résiduels 1
  • Les calculs d'infection nécessitent un retrait complet car même de petits fragments peuvent servir de nidus pour récidive infectieuse 1, 3, 5

Suivi Post-Traitement

  • Évaluation métabolique du calcul après résolution de l'infection aiguë pour identifier les facteurs de risque de récidive 2
  • La bactériurie asymptomatique ne doit pas être traitée après traitement 2
  • Les antibiotiques prophylactiques ne doivent pas être utilisés de routine pour la lithiase sans infections urinaires symptomatiques récurrentes 2

References

Guideline

Guideline Directed Topic Overview

Dr.Oracle Medical Advisory Board & Editors, 2025

Guideline

Management of Urinalysis Findings Suggestive of UTI with Calcium Oxalate Crystals

Praxis Medical Insights: Practical Summaries of Clinical Guidelines, 2025

Research

Treatment of the Infected Stone.

The Urologic clinics of North America, 2015

Guideline

Management of a 5mm Ureterovesical Junction (UVJ) Stone

Praxis Medical Insights: Practical Summaries of Clinical Guidelines, 2025

Research

Stones and urinary tract infections.

Urologia internationalis, 2007

Professional Medical Disclaimer

This information is intended for healthcare professionals. Any medical decision-making should rely on clinical judgment and independently verified information. The content provided herein does not replace professional discretion and should be considered supplementary to established clinical guidelines. Healthcare providers should verify all information against primary literature and current practice standards before application in patient care. Dr.Oracle assumes no liability for clinical decisions based on this content.

Have a follow-up question?

Our Medical A.I. is used by practicing medical doctors at top research institutions around the world. Ask any follow up question and get world-class guideline-backed answers instantly.