What is the appropriate antibiotic therapy for a patient with COVID-19 and suspected secondary bacterial infection?

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Antibiothérapie appropriée pour les patients COVID-19 avec suspicion d'infection bactérienne secondaire

Pour les patients COVID-19 non gravement malades avec suspicion d'infection bactérienne pulmonaire secondaire, utilisez un antibiotique anti-pseudomonas unique (comme la pipéracilline-tazobactam, une céphalosporine de 3ème génération avec activité anti-pseudomonas, ou une fluoroquinolone respiratoire), tandis que pour les patients gravement malades en réanimation, ajoutez une couverture anti-MRSA (vancomycine ou linézolide) et envisagez une double couverture anti-pseudomonas selon l'épidémiologie locale. 1

Approche selon la gravité clinique

Patients non gravement malades (hors réanimation)

  • Pour les co-infections bactériennes précoces (≤48h d'admission): Suivez les recommandations locales/nationales pour la pneumonie communautaire, couvrant les pathogènes typiques et atypiques 1, 2

  • Les options incluent une bêta-lactamine (amoxicilline-acide clavulanique ou céphalosporine de 3ème génération) 2

  • Évitez les macrolides et quinolones si le patient reçoit d'autres médicaments prolongeant le QT (comme l'hydroxychloroquine); considérez la doxycycline pour la couverture atypique si nécessaire 2

  • Pour les infections bactériennes secondaires (>48h d'admission): Prescrivez un antibiotique anti-pseudomonas unique - recommandation forte 1

Patients gravement malades (réanimation/ventilation mécanique)

  • Ajoutez une couverture anti-MRSA empirique (vancomycine ou linézolide) pour les co-infections pulmonaires chez les patients sélectionnés 1, 2

  • Pour les infections secondaires: Envisagez une double couverture anti-pseudomonas ET/OU des antibiotiques anti-MRSA selon l'épidémiologie locale 1

  • Les patients gravement malades ont un risque plus élevé d'infections bactériennes associées au COVID-19 et peuvent nécessiter des antibiotiques 1, 3

Pathogènes les plus fréquents

  • Infections secondaires (>2 jours après admission): Entérobactéries et Staphylococcus aureus sont les plus fréquents 4

  • Co-infections respiratoires précoces: Staphylococcus aureus et Haemophilus influenzae 4

  • Bactériémies: Escherichia coli et S. aureus 4

  • Acinetobacter baumannii, espèces de Klebsiella, et Pseudomonas aeruginosa sont également fréquemment isolés 5, 6

Investigations diagnostiques avant l'antibiothérapie

  • Obtenez des cultures d'expectorations et hémocultures avant de débuter l'antibiothérapie empirique 1, 2

  • Effectuez un test antigénique urinaire pneumococcique chez tous les patients 1, 2

  • Effectuez un test antigénique urinaire Legionella selon les recommandations locales 1, 2

  • Pour les tests PCR multiplex syndromiques: Utilisez des échantillons du tube endotrachéal ou du lavage broncho-alvéolaire, PAS d'écouvillons nasopharyngés - recommandation forte 1, 3

  • Effectuez toujours des cultures conventionnelles en parallèle avec les tests PCR 1, 3

Biomarqueurs pour guider la décision

  • Procalcitonine >0,5 ng/mL suggère une infection bactérienne, mais ne doit pas être utilisée seule pour décider du début des antibiotiques, surtout chez les patients non gravement malades 1, 3

  • Leucocytose et CRP élevée peuvent également suggérer une co-infection bactérienne 1, 3

  • Restreignez les antibiotiques chez les patients avec procalcitonine initiale <0,25 ng/mL 1, 3

Durée et désescalade

  • Arrêtez les antibiotiques après 48 heures si les cultures sont négatives et le patient s'améliore 1, 2, 7

  • Durée suggérée de 5 jours lors de l'amélioration des signes, symptômes et marqueurs inflammatoires 1, 7

  • Envisagez une désescalade précoce chez les patients avec procalcitonine <0,25 ng/mL 1, 3

  • Effectuez des mesures sériées de procalcitonine chez tous les patients hospitalisés, particulièrement en réanimation 1, 3

Pièges à éviter

  • Les co-infections bactériennes sont rares (5% dans les 48h d'admission en réanimation) - évitez l'antibiothérapie empirique systématique 5, 4

  • L'utilisation excessive d'antibiotiques (85,2% des patients COVID-19 hospitalisés reçoivent des antibiotiques alors que les infections confirmées sont rares) favorise la résistance antimicrobienne 4, 6, 8

  • Les anomalies radiologiques chez les patients COVID-19 ne signifient pas nécessairement une co-infection bactérienne - elles peuvent être dues à l'infection virale seule 2

  • Ne prescrivez PAS d'antibiotiques de routine aux patients COVID-19 recevant des immunomodulateurs (corticoïdes, inhibiteurs d'IL-6) 1

References

Guideline

Guideline Directed Topic Overview

Dr.Oracle Medical Advisory Board & Editors, 2025

Guideline

Antibiotic Use in COVID-19 Patients with Suspected Bacterial Co-infection

Praxis Medical Insights: Practical Summaries of Clinical Guidelines, 2025

Guideline

Diagnosing Bacterial Co-infection in COVID-19 Patients

Praxis Medical Insights: Practical Summaries of Clinical Guidelines, 2025

Research

Bacterial infection, antibiotic use and COVID-19: Lessons from the intensive care unit.

South African medical journal = Suid-Afrikaanse tydskrif vir geneeskunde, 2021

Research

The interface between COVID-19 and bacterial healthcare-associated infections.

Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2021

Guideline

Antibiotic Management for COVID-19 Patients with Sinusitis

Praxis Medical Insights: Practical Summaries of Clinical Guidelines, 2025

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